Les études doctorales font suite au cycle des Masters Recherche, et structurent les années de préparation au Doctorat.
Les thèses labélisées "recherche et création" ont des attendues spécifiques. Se reporter au
Les étudiant-e-s titulaires d'un Master Recherche peuvent être autorisé-e-s à s'inscrire en Doctorat, ainsi qu'à certaines conditions les étudiants titulaires d'un Master Professionnel, d'autres diplômes français ou étrangers et sur VAE (valorisation des acquis de l'expérience). Le niveau minimum requis est une Mention Bien. Une procédure exceptionnelle existe pour les étudiant-e-s bilingues, et en particulier étranger-e-s, qui leur permet d'inscrire et de préparer leur thèse à la fois à Paris 3 et dans une université étrangère. L'étudiant-e est dirigé-e par deux professeur-e-s, l'un-e de Paris 3 et l'autre étranger-e, et le diplôme est reconnu dans les deux universités contractuelles. Il s'agit de la procédure, dite de
cotutelle, qui est soumise à l'agrément de la Commission de la Recherche de la Sorbonne Nouvelle.