Dans le cadre de la formation doctorale les écoles doctorales sont des composantes qui rassemblent les unités de recherche de l'université. Elles ont pour mission d'organiser la formation doctorale. Elles accompagnent les doctorants dans la recherche de financement et attribuent les contrats doctoraux. Dans le respect de la charte des thèses, les écoles doctorales veillent sur la qualité de l'encadrement des doctorants dans les unités de recherche par les directeurs de thèse.
Les écoles doctorales assurent la promotion des cotutelles internationales de thèse dans le cadre d'actions de coopération conduites avec des établissements d'enseignement supérieur ou centres de recherche étrangers.
Les écoles doctorales préparent l'insertion professionnelle des docteurs. Elles mettent en œuvre les dispositifs d'appui à l'insertion professionnelle des docteurs, tant dans les établissements publics que dans le secteur privé.